وب سنجی وب سایت های زیر مجموعه دانشگاه علوم پزشکی خراسان شمالی به صورت دو مرحله در هر سال صورت می گیرد که مرحله اول ارزیابی در تیر ماه و مرحله دوم آن در دی ماه هر سال می باشد.
در این ارزشیابی ها، بر اساس نیاز پورتال دانشگاه، شاخص هایی توسط کارشناسان واحد پورتال و وب سایت تهیه و تدوین شده و به کلیه واحد های دانشگاه اعلام خواهد شد که واحد ها تا زمان شروع ارزیابی فرصت خواهند داشت تا محتوا و ساختار وب سایت خود را بر اساس شاخص های اعلام شده، بروزرسانی کنند و در نهایت پس از انجام فرآیند ارزشیابی وب سایت، هر واحد امتیازی را کسب می کند و اسامی کلیه واحد ها بهمراه واحد های برگزیده اعلام خواهد شد.